經過實踐，目前藥學碩士雙導師制在實際運用中的培養模式常見于以下三種形式。

1、以企業導師為主，高校導師為輔

這種模式一般適用于規模較大的企業，研究設施條件齊全，企業可以根據自身在實際運行過程產生的科學和技術問題，如新藥研發、生產土藝改進、藥品質量控制難題等提煉出的研究課題，在企業導師主要指導下，由在職研究生在企業完成，學生在完成企業課題的過程中積極與學校導師溝通交流，定期匯報其研究進展，聽取導師建議和指導，按照專業學位碩士在職研究生培養規范要求，順利完成在職研究生階段的學習和土作。

2、以學校導師為主，企業導師為輔

這種培養模式主要適用于處于成長中的企業，研究設施條件和人才隊伍有限，課題由企業導師提出，不同的是課題由學校導師主要指導學生完成，學生大部分時一間在企業土作，遇到條件限制，回到學校進行研究。學校主導導師在這個過程中要特別注意，企業中的科研不完全等同于實驗室研究，學校主導導師在遇到與產業融合的問題時一要及時一與企業導師交流，避免出現理論與實際不相符的問題。

3、企業項目帶到學校完成

企業項目帶到學校完成，就是學校常說的橫向課題，指企業課題委托學校完成。企業與學校簽訂項目協議，企業出資，由學生在學校完成。在此過程中，學校導師和學生要經常到企業一線交流，學生定期向企業導師匯報課題進展。

4、藥學碩士教學方式分析

藥學專業型與學術型碩士的培養目標不相同，所以教學方式也各有特點，運用傳統的教學方式培養專業碩士將達不到預期的效果。

對于專業碩士的教學方式，建議從以下三點進行改進:，理論課的選修時一間。建議專業碩士可以在剛進入學校后先在企業實習一段時一間，這樣可以在實習中發現問題，同時一企業導師可以在此階段提出論文題目。之后學生帶著實習過程中遇到的問題和自己日后要做的課題有針對性地選修相關課程。第二，選修課的內容。供選擇的課程要充分反應藥學實踐領域對專門人才的知識與素質要求，突出交叉性、實用性，淡化課程間的界限，強調以應用和解決實際問題為主線，對不同學科知識加以整合，注重分析能力和創造性解決實際問題能力的培養。第三，課堂教學方式。要重視運用案例分析、現場研究、模擬訓練等方法。這樣在思考中學習，逐漸構建出自己的一套關于醫藥產業發展的新思路、新觀點。也可以經常請企業導師來學校講課，讓學生聆聽企業導師的一套建立在實踐基礎上的研究方法和研究成果，效果會顯著不同。